Stefan Mäder promovierte an der Universität Zürich im Bereich Wirtschaftswissenschaften und startete seine Karriere als Ökonom bei der Schweizerischen Nationalbank. Anschliessend wurde er zur Zurich Versicherung berufen. Dort war er in verschiedenen Führungsfunktionen tätig, zuletzt als Finanzchef der Region Europa.
2010 wechselte er als Finanzchef und Mitglied der Konzernleitung zur Schweizer Börsenbetreiberin SIX Group. Seit seinem Rücktritt 2017 bei der SIX ist Stefan Mäder als unabhängiger Verwaltungsrat tätig. In den vergangenen Jahren hielt er mehrere VR-Mandate, unter anderem bei der Schroder & Co. Bank AG und Compenswiss, dem Ausgleichsfonds AHV/IV/EO.
Seit 2013 gehört Stefan Mäder dem Verwaltungsrat der Mobiliar Genossenschaft an, vier Jahre später nahm er Einsitz im Verwaltungsrat der Mobiliar Holding AG. Seit Mai 2023 ist Dr. Stefan Mäder Verwaltungsratspräsident der Mobiliar.